In den vergangenen Jahren konnten die Kosten für Brennstoffzellen erheblich reduziert werden. Der Preis für Brennstoffzellen lag im Jahr 1990 noch bei 5.000,- €/kW und zehn Jahre später nur noch knapp bei einem Zehntel. Von Seiten der Automobil-Hersteller hieß es Ende 1998 noch, jedes einzelne Kilowatt für eine komplette Brennstoffzellen-Anlage inklusive der Nebenaggregate koste 2.500,- bis 5.000,- Euro. Die Kosten für komplette Brennstoffzellen-Antriebe belaufen sich etwa auf 800 €/kW, während Verbrennungskraftmaschinen bei rund 25 €/kW liegen.
Die Lage im Brennstoffzellen-Bereich verbessert sich zwar zunehmend, konkurrenzfähig sind Brennstoffzellen jedoch noch immer nicht. Der angenommene Grenzwert, um auf dem Markt konkurrenzfähig sein zu können, liegt für komplette BSZ-Anlagen inklusive der Nebenaggregate für

• BHKW-Systeme bei 1.200,- €/kW.
• Hausenergie-Versorgungssysteme bei 300 - 500,- €/kW.
• Bus-Systeme bei 150,- €/kW.
• Pkw-Systeme bei 50,- €/kW.

Bei PEM-BSZ belaufen sich die Materialkosten auf über 80 %. Pro Quadrat-Zentimeter einer Brennstoffzelle sind beispielsweise ungefähr 0,1 mg Platin notwendig. Das bedeutet, dass für ein Stack mit einer Leistung von 75 kW eine Platinmenge von 112 g und Kosten von 1.800,- Euro anfallen. Die Reduzierung dieser Platinmenge ist unbedingt notwendig, da sie bisher mehr als ein Drittel der Kosten ausmacht.
Ebenfalls sehr teuer ist die Membran. Ein Quadratmeter Membranfolie für PEM-Brennstoffzellen kostet ungefähr 500,- Euro.

Abb.: Kostenaufteilung bei stationären Brennstoffzellen

[Linssen, 2002]